计算机技术与应用系下设职能机构如下：

教学管理部  

    各课程组
 

学生管理部

    各班级

    系学生会

    腾讯俱乐部

办公室

实验室管理部 

    信息技术实训中心  

    国家保密局青海省测评分中心（青海大学计算机系网络与信息安全研究中心）  

    青海大学三江源数据分析中心(青海大学计算机系高性能计算中心)

    各教学、科研实验室